Skv. 3. grein laga um Byggðastofnun nr. 106/1999 skipar ráðherra á ársfundi sjö menn í stjórn Byggðastofnunar til eins árs í senn og sjö menn til vara. Ráðherra skipar formann og varaformann og ákveður þóknun stjórnar.
Stjórn Byggðastofnunar var skipuð á ársfundi Byggðastofnunar 5. apríl 2013 og í henni sitja:
Aðalmenn
Þóroddur Bjarnason, formaður, Akureyri
Rögnvaldur Ólafsson, Reykjavík
Guðmundur R. Gíslason, Neskaupstað
Ólafía Jakobsdóttir, Kirkjubæjarklaustri
Matthildur Helgadóttir Jónudóttir
Valdimar Hafsteinsson, Hveragerði
Ólöf Hallgrímsdóttir, Mývatni, varaformaður
Varamenn
Þorsteinn Gunnarsson, Akureyri
Guðný María Jóhannsdóttir, Reykjanesbæ
Jóna Árný Þórðardóttir, Neskaupstað
Steingerður Hreinsdóttir, Selfossi
Peter Weiss, Flateyri
Bergsteinn Einarsson, Selfossi
Guðrún Þóra Gunnarsdóttir, Hólum
Stjórn Byggðastofnunar frá upphafi
Skipurit
